El desarrollador principal de Assassin's Creed Shadows asegura a los jugadores que centrarse en un solo protagonista no afectará significativamente su experiencia general. El juego presenta dos personajes jugables: Naoe, una shinobi femenino y Yasuke, un samurai africano histórico, una elección que ha generado una discusión previa a la liberación.
Las preocupaciones surgieron entre los fanáticos de que priorizar a un personaje podría conducir a perder puntos de trama cruciales o juego. El director creativo Jonathan Dumont abordó estas preocupaciones, describiendo su propio enfoque equilibrado: generalmente juega 3-5 horas con un personaje antes de cambiar al otro durante 2-3 horas.
Sin embargo, Dumont aclaró que los jugadores no serán penalizados por favorecer a un personaje. Si bien cada protagonista cuenta con secuencias introductorias únicas y historias personales, la narrativa del juego se adapta a la elección del jugador. Anima a los jugadores a jugar como su personaje preferido:
"No creo que te pierdas mucho. Realmente depende de tu estilo de juego. Podrías pensar: 'Veamos cómo cambia el juego en función de quién elijo'. Cada héroe tiene sus propias misiones iniciales y personales únicas, pero la experiencia principal es adaptable a tu favorito, y la historia se ajustará ".