De hoofdontwikkelaar van Assassin's Creed Shadows verzekert spelers dat het focussen op een enkele hoofdrolspeler hun algehele ervaring niet aanzienlijk zal beïnvloeden. De game bevat twee speelbare personages: NAOE, een vrouwelijke shinobi en Yasuke, een historische Afrikaanse samurai, een keuze die de discussie voor de release heeft gegenereerd.
Er ontstonden bezorgdheid onder fans die prioriteit geven aan één personage kan leiden tot het missen van cruciale plotpunten of gameplay. Creatief directeur Jonathan Dumont ging over deze zorgen en beschrijft zijn eigen evenwichtige aanpak: hij speelt meestal 3-5 uur met het ene personage voordat hij 2-3 uur naar het andere overschakelt.
Dumont verduidelijkte echter dat spelers niet worden bestraft voor het bevoordelen van één personage. Terwijl elke hoofdrolspeler unieke inleidende sequenties en persoonlijke verhaallijnen beschikt, past het verhaal van de game zich aan aan de keuze van de speler. Hij moedigt spelers aan om te spelen als hun favoriete personage:
"Ik denk niet dat je veel zult missen. Het hangt echt af van je speelstijl. Je denkt misschien: 'Laten we eens kijken hoe de game verandert op basis van wie ik kies.' Elke held heeft zijn eigen unieke begin- en persoonlijke missies, maar de kernervaring is aanpasbaar.
